1、主要职责
拟订分局海洋科技发展规划；承担分局海洋科技项目、科技成果、知识产权的管理工作；组织实施海区海洋基础与综合调查；监督管理海区海洋信息资料，承担海区科技平台和数字海洋建设；承担海区科技兴海战略的有关工作；监督管理海区海水利用和海洋可再生能源研发、应用；承办分局领导交办的其他事项。
2、内设机构
根据上述职责，海洋科学技术处内设2个科级机构。
（1）科技发展科
①承担分局海洋科研的综合协调，拟订并组织实施海洋科技发展、产业化规划和政策；
②组织海洋科技创新和推广应用体系建设，组织实施海洋科技体制改革；
③拟订并实施科技兴海规划，组织实施海洋科技成果的鉴定、奖励、转化、推广和产业化；
④承担成果转化和产业化基地、工程技术中心等平台的建设与管理工作；
⑤组织开展海洋应用基础、公益技术、实用技术研究，组织实施海洋公益性行业科研专项；
⑥承担海洋领域知识产权、科技统计、学会和科普的管理工作；
⑦组织和管理重点实验室、青年基金、局长基金、科技基础性工作、政策引导类科技计划、国外海洋技术引进工作；
⑧承办处领导交办的其他事项。
（2）高新技术与调查保障科
①根据国家海洋调查的法律、法规和规划，指导监督分局海洋调查工作；
②组织实施海洋基础、综合调查与评价；
③组织和管理分局海洋领域高新技术研究和应用工作；
④组织管理海洋领域基础研究和科技计划项目；
⑤负责分局“数字海洋”的管理工作；
⑥承担海洋调查数据、样品库（馆）、野外科学观测研究站的建设与管理；
⑦组织海洋重大基础研究和军事海洋学研究；
⑧承担科技保密、科技特种情报资料管理；
⑨承办处领导交办的其他事项。
3、人员编制
海洋科学技术处人员编制7人，其中：处长1名，副处长1名，科级领导职数2名。